Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C19orf12Q9NSK7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C19orf12Q9NSK7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms