Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms