Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms