Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms