Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F12Q9HCS2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms