Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPN1Q9HCN4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms