Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms