Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSER1Q9C0I3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms