Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms