Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms