Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms