Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms