Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms