Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms