Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms