Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms