Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LPIN3Q9BQK8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms