Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms