Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms