Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EYA3Q99504 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms