Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms