Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms