Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms