Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms