Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms