Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PGAM5Q96HS1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGAM5Q96HS1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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