Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms