Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EME1Q96AY2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms