Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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COPS9Q8WXC6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
COPS9Q8WXC6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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