Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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