Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms