Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF398Q8TD17 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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