Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71DQ8N9W8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms