Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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C9orf40Q8IXQ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf40Q8IXQ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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