Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms