Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms