Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC80Q76M96 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC80Q76M96 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC80Q76M96 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC80Q76M96 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms