Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms