Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms