Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms