Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms