Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms