Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms