Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RWDD4Q6NW29 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms