Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMBOX1Q6NT76 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms