Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms