Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms