Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms