Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms