Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms